Category: коронавирус

Category was added automatically. Read all entries about "коронавирус".

Cherry

Оглавление

Журнал мой не имеет одного тематического направления, пишу о всем, что меня интересует или в голову взбредет. История, космос, авиация, фотографии мои и чужие, американское житье-бытье, социология, медицина, экономика, оружие, и так далее.

Collapse )
Cherry

Проблемы публикации про российскую ковид-вакцину

В прошлую пятницу в авторитетном* журнале "Ланцет" вышла статья про российскую ковид-вакцину: Safety and immunogenicity of an rAd26 and rAd5 vector-based heterologous prime-boost COVID-19 vaccine in two formulations: two open, non-randomised phase 1/2 studies from Russia.
* Impact Factor в прошлом году -- 60.392, это очень высокий уровень

А сегодня приятель кинул мне вот эту ссылку: Note of concern. Там указывается на явную странность в вышеуказанной статье, а именно, повторяющиеся на графиках визуализации данных:



Collapse )

Некоторые отмеченные цветом визуализации "просто" очень похожи, некоторые и вовсе идентичны. Вероятность того, что такие измерения могли быть получены случайно, весьма мала.

Теперь авторы Note of Concern просят у российских ученых публикации исходных данных, использованных для создания графиков.


update: Safety and efficacy of the Russian COVID-19 vaccine: more information needed – Authors’ reply
Cherry

Эффективность различных масок для лица

Попалась интересная публикация, вышедшая в Science на прошлой неделе: Low-cost measurement of facemask efficacy for filtering expelled droplets during speech. Вкратце, с помощью лазерной приблуды ученые оценили сколько капель оказывается в воздухе, когда человек в маске говорит (НЯП, воздушно-капельный путь передачи всё ещё считается для ковида основным). Были испытаны вот эти 14 видов масок, от N95 до банданы. В виде контроля -- отсутствие маски.



Collapse )

Для каждой маски подсчитывались воздушные капли как % от контроля. Измерение проводилось так: первые 10 секунд база, в следующие 10 секунд владелец маски пять раз повторил фразу "Stay healthy, people", после чего камера вела запись еще 20 секунд. Точка на графике -- среднее кол-во за десять измерений, вкупе с вариацией. Пустые кружочки более интересны, ибо это средние данные четырех подопытных, вместо одного для заполненных кружочков.



Результат:
- Должным образом примеренная N95 оказалась самой эффективной, тут сюрприза нет.
- Хирургическая маска сравнима по эффективности с лучшими представителями тряпичных самоделок из х/б и синтетики, как и с не примеренной N95 с клапаном.
- Самодельные маски весьма разнятся по эффективности (впрочем, тут ещё и люди разные на графике)
- От бандан, флиса и вязаных масок толку мало.

Как-то так. И пара уточнений:
- Это НЕ оценивает личную защиту, это оценивает то, насколько маска на больном защищает других от заражения.
- При прочих равных, одноразовые маски намного предпочтительнее многоразовых, ибо последние со временем потенциально становятся резервуаром инфекции.

До кучи, данные в динамике для каждой маски:

Collapse )

И гистограммы размера капель в сравнении с контролем:

Collapse )
Cherry

Оштрафовали за карикатуру Ёлкина

Из решения суда:

Согласно протоколу об административном правонарушении...разместил на своей странице в социальных сетях <данные изъяты> публикацию с карикатурой Президента РФ с надписью: «Извини, чувак, но это надо для пиара, с хештегами Путинвор, Путинболтун, ЕдинаяРоссиясдохла, коронавирус, тем самым разместил сведения порочащие честь и достоинство Президента РФ Путина В.В.
<...>
Руководствуясь ст. ст. 29.9, 29.10 КоАП РФ, суд ПОСТАНОВИЛ:
Назначить...административное наказание по ч.3 ст. 20.1 КоАП РФ в виде штрафа в размере 30000 (тридцать тысяч) рублей.


В силу того, что я тоже слегка не уважаю власть, и при этом уважаю эффект Стрейзанд, вот эта карикатура:



P.S. ББС:

Согласно описи гуманитарного груза, предоставленной телекомпании ABC американским агентством по чрезвычайным ситуациям (FEMA), на борту российского транспортника находилось 4 тысячи промышленных противогазов М-95, полностью закрывающих лицо, 15 тысяч респираторов, 80 тысяч упаковок антисептика, 400 тысяч различных предметов медицинской одежды, включая защитные комбинезоны, и 30 тысяч перчаток. Среди них, правда, оказались как хирургические, так и резиновые, используемые на кухнях. Кроме этого, в США были доставлены 45 аппаратов вентиляции легких "Авента-М".
<...>
В агентстве FEMA также подчеркнули, что вопрос об оплате американской стороной "гуманитарного груза" уже решен. "Госдепартамент получил итоговый счет, выставленный правительством России, на сумму в $659 283, - сообщили в агентстве. - После того как будет закончено оформление необходимых документов, Госдепартамент оплатит выставленный счет, а FEMA, в свою очередь, возместит дипломатическому ведомству понесенные расходы".


P.P.S. Изначально в названии было сказано, что оштрафовали самого Ёлкина. Это неверно, оштрафовали другого человека за перепост его карикатуры. Приношу свои извинения. В мою защиту, в решении суда удалены ссылки на соцсети, а увидев иную фамилию ответчика, я ошибочно подумал, что Ёлкин это псевдоним художника. Впрочем, по сути это мало что меняет.
Cherry

Как я изучал туберкулёзные бактерии

Десять лет назад я работал в IT. Сейчас я тоже работаю в IT. Но в середине декады моя карьера выдала неожиданный зигзаг, и в течении нескольких лет я был микробиологом. В числе прочего, я занимался исследованиями туберкулеза в лаборатории с третьим уровнем биологической безопасности (далее "BSL-3"). Всего этих уровней четыре, подробнее про них можно прочесть тут, например. Вкратце, BSL-1 это самый травоядный уровень, а BSL-4 самый крутой, где изучают вещи вроде эболы. Третий уровень это чума, туберкулез, Западный Нильский вирус, коронавирус SARS, и т.п.

И решил вот написать пост про тот период в моей жизни -- с упором на повседневные реалии работы в лаборатории BSL-3. Думаю, это может быть многим интересно в силу нынешних обстоятельств, особенно учитывая официально прозвучавшие на этой неделе обвинения со стороны американской администрации, что -де коронавирус SARS-CoV-2 мог вырваться из китайской лаборатории в Ухани из-за небрежности тамошнего персонала.

Collapse )
Cherry

Модель распространения и смертности ковида

Попалась интересная ссылка: Second Version of a COVID-19 Simulator. В написанной в матлабе модели 8 параметров:
Collapse )



Результат одной из симуляций (по ссылке выше рассмотрено несколько различных сценариев):



Анимашка:

Collapse )

Дисклеймер -- модель довольно упрощенная, но понимание динамики распространения и мортальности она даёт. Тот же автор до кучи на этой же основе сделал симулятор распространения фейковых новостей, если кому надо.
Cherry

Коронавирус и нефтянка

Прогноз спотовой стоимости нефти от EIA. По оценке STEO, баррель WTI не поднимется выше сорока долларов до следующего года. Причем рынок настроен даже пессимистичней, средняя цена фьючерсов ниже $40 до конца 2021.



Collapse )
Cherry

Карантин во время эпидемии испанского гриппа

Любопытно рассмотреть действия руководства двух американских городов во время эпидемии испанского гриппа.

В Филадельфии плюнули на всё, и даже устроили парад:



А в Сент-Луисе через два дня после первых случаев заболевания в городе, закрыли школы, детские площадки, библиотеки, суды, и даже церкви; было запрещено собираться в общественных местах группами более двадцати человек; были приняты меры по организации рабочих смен и работе общественного транспорта.

И результат. Избыточная подушевая смертность в Филадельфии и Сент-Луисе в сентябре-декабре 1918, по сравнению с периодом 1913-1917 (отсюда):



На графике выше отлично видно, в чем смысл карантина -- кроме некоторого уменьшения количества обших случаев, мы еще и размазываем их по времени, что позволяет системе здравоохранения лучше справляться с эпидемией. Добрые люди уже даже гифку сделали, которая это объясняет:

Collapse )

Тут поясняют смысл карантина более развернуто: коронавирус — есть ли смысл в карантине? И там же интересный пост, коронавирус и грипп — хрен vs. редька
Cherry

Первая серьезная эпидемиологическая публикация про коронавирус

В New England Journal of Medicine вышла статья: Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia. Тут научпоп на английском: Early Wuhan coronavirus study focuses on minimizing spread.

Исследователи изучили 425 случаев болезни в Ухане. Стал лучше понятен инкубационный период болезни, медианное значение -- 5.2 дня. Вот визуализации данных, кликабельно:



Серийный интервал -- период времени от появления симптомов у первичного пациента до появления симптомов у пациента, контактировавшего с ним.

Ещё несколько интересных фактов об этой выборке:
- Передача болезни от человека к человеку началась сразу же, с середины декабря.
- В начале немалая часть случаев связана с рынком морепродуктов Хуанан, см. иллюстрацию. Это работает против моей изначальной версии об утечке из лаборатории BSL-4, хотя и не опровергает её.
- Среднее количество инфицированных каждым больным -- 2.2 человека. Количество инфицированных удваивалось каждые 7.4 дня.
- Медианный возраст пациентов -- 59 лет. Заболевших младше 15 лет в выборке не было.

Ну и вот до кучи таблица с более подробной разбивкой выборки (пардон, что не стал переводить):

Collapse )
Cherry

Коронавирус

Оказывается, в городе Ухань, где началась эпидемия коронавируса, три года назад открыли биолабораторию четвертой (высшей) степени опасности (см. классификация патогенности). Это настолько редкие лабы, что в вики есть список оных по всем странам -- для материкового Китая там приведена только одна, эта. Подробнее про эту китайскую лабу можно почитать в статье Nature: Inside the Chinese lab poised to study world's most dangerous pathogens.

Ну и ещё одно, уже анекдотичное, совпадение. Cлева -- логотип некоей занимающейся биотехом компании из Уханя Шанхая. А справа -- логотип вымышленной биотех корпорации Umbrella из фильмов "Обитель зла", которая по сюжета виновна в глобальной биологической катастрофе.



P.S. Да, и напоминание -- хирургические маски (как на фото ниже) чуть менее, чем полностью бесполезны для защиты от инфекционных заболеваний. Их стоит надевать только больным, чтобы сопли по округе не разлетались.



Collapse )