April 26th, 2017

Cherry

Мысли о кризисе воспроизводимости в науке

Если вы не в курсе, сейчас в научных кругах много говорят о так называемом "кризисе воспроизводимости". Вкратце, многие научные статьи, в том числе и в очень престижных журналов, не соответствуют критерию воспроизводимости; то есть попытки повторить те результаты оказываются неудачными. См. reproducibility crisis в гугле, да и в рунете наверняка что-то на тему есть. А ведь воспроизводимость есть основополагающий принцип научного метода, без неё всё сыплется.

Так вот. До того как я в начале этого года вернулся в теплые объятия ойтишной индустрии, я несколько лет проработал микробиологом, just for lulz. Особых лавров на этом поприще не сыскал, но одну публикацию, где я первый автор, таки приняли в неплохом журнале, Докладах Академии Наук США (Proceedings of the National Academy of Sciences). Если вкратце, я фотографировал одни и те же микобактерии в микродивайсе со сквозным течением питательного раствора и (часть времени) антибиотика в течении длительного пероида (~дни), и пытался определить чем те бактерии которых убивает антибиотик рифампицин отличаются от выживших. У меня там была программка для свода аннотаций этих бактерий в единую экспериментальную базу данных, даже графическую оболочку под этот процесс сделал. И была вторая программка для всяческого статистического анализа и моделирования на основе той базы данных. В общем в MATLABе получилось несколько тысяч строк (это не считая кода который сгенерил guide для графической оболочки). Причем делал в данном отношения все я один – сам себе программист, сам себе тестер.

читать дальшеCollapse )