March 26th, 2014

Cherry

Немного забавной статистики о бактериях в вашей пищеварительной системе

Общий среднестатистический вес всех бактерий в кишечной флоре взрослого человека -- до трех килограмм.

Совокупный геном этих бактерий -- около десяти миллионов генов. У человека, для сравнения, "всего" двадцать тысяч генов. Это в разы меньше чем у многих видов цветов, кстати.

После обеда в вашей крови может быть обнаружено около пятиста различных химических соединений. Из них в районе пятидесяти -- продукт метаболизма желудочных бактерий.
Cherry

О дивный новый мир

Давно уже хотел написать пост о синтетической геномике, а также о большом пизд потенциальных опасностях ожидающих человечество из-за прогресса в этой области.

Дла начала краткий ликбез о ДНК. Те кто помнят школьную программу могут пропустить это параграф. Итак, наследственная информация человека закодирована в цепочках ДНК (дезоксирибонуклеиновой кислоты), которые упакованы в хромосомы. Базовый информационный кирпичик ДНК это нуклеотид, их в ДНК четыре вида (т.е. один нуклеотид ДНК можно смоделировать как сочетание двух битов). Определенная последовательность этих кирпичиков является набором информации, необходимой для построения организма и поддержания его жизнедеятельности. В двойной цепи ДНК один такой кирпичик информации называют "базовая пара". В человеческом геноме содержится примерно три миллиарда базовых пар, и где-то двадцать тысяч генов. Подробнее о ДНК можно почитать тут, например.

Взглянем на этот график. Фиолетовая прямая это закон Мура. Зеленая кривая это изменение стоимости полного секвенирования одного человеческого генома, т.е. определения точной последовательности базовых пар во всей ДНК отдельно взятого человека.



Видите как сильно упала стоимость секвенирования всего за полторы декады, и насколько она опережает рост производительности компьютеров в последние лет восемь? Вот немного цифр, дабы было лучше понятно. Секвенирование первого человеческого генома заняло 15 лет и стоило три миллиарда долларов. Уже в этом году в свободной продаже появится автомат HiSeqX10, способный менее чем за день секвенировать один человеческий геном где-то за тысячу долларов.

Читать дальшеCollapse )